ERP'nin stok modülü stok kartını, miktarı, maliyeti ve malın hangi depoya ait olduğunu tutar; muhasebe, satın alma, satış ve e-belge süreçleriyle aynı sistemde çalışır. Cevapladığı soru "ne kadar var, değeri ne?" sorusudur.
Depo yönetim sistemi (WMS, Warehouse Management System) bu miktar bilgisinin altına fiziksel katmanı ekler: koridor, raf, kat ve göz düzeyinde adres; mal kabul, yerleştirme, toplama, sevkiyat ve sayım adımlarının el terminalinde okutularak kayda geçmesi; hangi partinin önce çıkacağını belirleyen kural. Cevapladığı soru "mal tam olarak nerede, kim aldı, hangisi önce çıkmalı?" sorusudur.
WMS ERP'nin yerine geçmez. Muhasebe, cari ve e-belge ERP'de kalır; WMS depodaki hareketleri ERP'ye stok hareketi olarak geri bildirir. Bu yüzden asıl soru "ERP mi, WMS mi?" değil, "ERP'nin stok modülü bizim depo için yeterli mi, yoksa yanına bir depo katmanı mı gerekiyor?" sorusudur.
Bu ayrım ERP üreticilerinin ürün yapısında da görülür. Örneğin Logo Yazılım, sitesinde depo yönetimini ERP ürünlerinden ayrı bir ürün kategorisi olarak sunuyor (Logo Edge WMS Basic ve Logo Edge WMS Platform); ürün sayfalarına göre stok, cari ve sipariş gibi sabit kartlar ERP'den WMS'e, satın alma, üretim ve sevkiyat süreçleri WMS'ten ERP'ye eşitleniyor (logo.com.tr, erişim 19 Ekim 2026). Bu yalnız bir örnektir; kullandığınız ERP'de depo tarafının ana pakette mi, ek modülde mi, ayrı bir üründe mi olduğunu kendi üreticinize ya da iş ortağınıza sorun.